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>帰りはミュンヘン(南)→フランクフルト(北)→帰国という形にしたいです。

この部分がどちらにすべきかをすべて物語っている気がするのですが・・・

イタリア(南)→スイス(真ん中)→ドイツ(北)がどうみても正解のような気がするのは自分だけでしょうか。スイス→イタリア→ドイツの場合、イタリアを南北に往復しなきゃなりませんよねえ?何を迷っておられるのかイマイチつかめません。