実際のところ必要ないでしょう。。

心配になるようでしたらしておけば良いと思いますが、実際のところ自分もチェコ航空(CSA)はここのところ年に何度か利用する機会がありますが、リコンファームは一度もやったことがありません。

おそらく、日本のチェコ航空の職員が「リコンファームは必要です!!」と言ったのは、「しておいたほうがより確実です。」といった程度の意味合いであったか、
あるいは共産時代から改定されずに残っている規約があってそれをそのまま伝えられたのだろうと推測します。

まぁ、やっておいたほうが気休めにはなるかと思いますんでやるのは大いに結構なのですが、実際やらなくても問題無いと思います。
とりわけフランクフルトからプラハなんて日に何便も飛んでる路線ですし。