先日利用しました。

私もチェコ航空を含んだフライトを、ANAで発券しました。
利用区間は多分違いますが、喫煙席はなかったと思います。
(というか、まだ喫煙席のある航空会社があるんでしょうか?)

座席指定は、チェックインの時にできましたよ。
私も通路側にしてもらいました。