1等2等と分かれているのでは・・

私もアッシジは行ったことがないのでわかりませんが、
フィレンツェからピサまでは普通列車で行きました。
行きは自動発券機で、2等を選択しました。
ちなみに指定席ではありません。
よってチケットを買うと、どの時間帯の列車に乗ってもよかったです。

ピサからフィレンツェまでは、ピサ駅の窓口で購入しましたが、
フィレンツェまでと言うと、小さいチケットを渡されただけ。

トイレは、ESスター(ローマ～フィレンツェ間)で1度行きました。
普通です。
汚い場合が多いかも・・・。

普通列車にトイレってあるんですかね?
お子さんとご一緒だとあらゆる面で大変でしょうが、
いざ行ってみると、日本であれこれ心配していたことは
なんだったんだろうって思ったりしましたよ。

もし心配であれば、乗る直前に駅のトイレに行くのはどうでしょう?
子供さんの場合、急にってこともあるし、難しそうですね～