オルーロ経由はいかがですか?

マチュピチュに先に行かれるご予定ですか?
その後陸路でボリビア入りされるのでしょうか?その場合、ペルーボリビア国境で時々問題が発生するようです。(汚職です)
空路ボリビア入りされるのなら問題ないと思います。(ただ空港が4100メートルに位置するため高山病の備えが必要でしょう。空港にも酸素ボンベがあるようですが・・・)
エルアルト空港を出てすぐのCejaというところに長距離バス発着所があり、そこからオルーロに向けてバスがほぼ毎時出ていますので、それでオルーロ入りされるのはいかがでしょうか?
Sorataさんもおっしゃっていたように、個人的にはラパス観光もおすすめですが、たしかに危険が増えているようなので十分注意が必要です。スペイン語が話せればそれだけ危険は減ると思いますが。それから郊外ではミニブス(15人乗りくらいの小さいバス)ごと誘拐するという大胆な犯罪も起きているそうです。
さてオルーロからはウユニに向けて鉄道が出ています。
列車は火金が午後3時半発、水日が午後7時発です。
約7時間でウユニに到着するのでおすすめは午後3時半発です。
一等車が101ボリビアーノス(約1500円)です。なかなか快適でサービスも良く、食堂車もありますので、壮大な景色を眺めながら食事を楽しむなんてことも可能です。
夜10時半にウユニに着くと、駅前にたくさんホテルがありますので、それほど危険を心配することはありません。
切符は一等車なら一週間前から買えます。
当日は売り切れの可能性もあります。
でも駅前にホテルがあるので時間に余裕があれば焦ることはないでしょう。
オルーロは比較的安全な街です。繁華街で携帯電話を盗まれたりすりの被害にあったり、ということは聞きますが、ラパスのような観光客相手の凶悪犯罪はほとんど聞きません。
ちなみにオルーロへは、チリのイキケからも国際長距離バスが出ています。約8時間だったと記憶しています。値段は80ボリビアーノス(1200円)です。陸路国境超えですが、特にやっかいなことは起こりませんでした。