ベネチアへ無理なく行けます

ベネチアに行きたいのであれば、行かれたほうがよろしいかと。ローマとフィレンツェが2日半ずつあるので、半日ずつ削ってベネチア1日が作れます。

ローマ到着後、空路でベネチア入り、午前休憩、午後散策。2日目午前観光、午後移動。16時頃からフィレンツェ散策。
3日目終日フィレンツェ観光　4日目午前ピサ、午後ローマへ。16時頃からローマ散策。
5,6日目ローマ観光。

全部鉄道ならローマから観光、北上し、最後の晩ローマ帰着の方が疲れないかと。長い日本からのフライトが着く日が一番疲れます。