まったく問題ないと思います。

1.について、
最近は、スターアライアンスとか各国の飛行機が2つぐらいの大きなグループになっていて、根本的にエコノミークラスの空席を出さないように飛んでいます。
ですから、フランクフルトは、他からの乗り継ぎ客を一人でも待ってくれています。
ロンドンからの乗り継ぎ客の遅れのため、フランクフルトの飛行機の中で1時間半も待たされたことがあります。その飛行機も遅れることなく成田に着きました。
最近のフランクフルト成田の飛行機は乗り継ぎ客をちゃんと待っていてくれるっていうのここ半年に3回経験してます。

2.について
注意して欲しいのは、チェックカウンターで、預け荷物に着けたバーコードの半券をチケットの封筒に貼ってくれるか、手渡されるのですが、それを絶対に成田でその荷物を受け取るまで、なくさないようにしてください。
荷物はいつもあなたの乗る飛行機と一緒に成田に着くはずです。
ただ、フランクフルトでは、また受け取って、預けるということはありません。あなたのトランクもフランクフルト飛行場の地下であなたの乗る飛行機の方へアッセンブリラインに乗って走ってます。
トランクが目的地に着かないというのは、ほとんどないようです。私も
他人が自分のと取り違えて持っていってしまったのを、友人のこともふくめて、3度経験があります。
でも、みな次の日、航空会社のサービスが無料で家まで届けてくれました。勿論、中身も無事に。

3.について、
ウィーンからはどの飛行機会社の飛行機で、何時にどのターミナル(1か2)に着くか分かれば、詳しく説明できるのですが。

ここのサイトのQ&A　(けろっこ)さんの
「フランクフルト空港ターミナル2から空港長距離駅まで」
を参照してみてください。
空港ターミナルの地図も見られます。(プリントしてよくみておくといいですよ。)
ただ、(nukepapa)さんの場合(けろっこ)さんとは逆行ですし、もっと分かりやすい順路があるので、長距離駅までの私の説明は参考にしないほうが、混乱しなくていいと思います。

空港で迷ったら、他の方がかかれたようにすぐ他の人に聞くことです。
サバイバル英語で十分です。