乗船ゲートイが違うだけだと思います。

香港～マカオは利用客が多いので、ピーク時は一つの窓口では捌ききれないのです。(笑)

切符売り場の窓口は並んで複数あり、カウンターの上に現在チケットを販売中の出船時間が電光掲示板で出ています。

その後乗船口へ向かって渡り廊下を越えたところに改札があり、あとは行き先と時間毎にゲートが分かれます。

マカオ行きはピーク時は15分毎に出船しますので、自分の買ったチケットの出船時間を確認して案内板に従って該当のゲート番号に進んで下さい。