どちらも行けると思います。

　なぜどちらかに絞る必要が有るのでしょうか…。
　十日間もあるのでしたら、どちらも行けると思いますが、私はどちらも行きました。
　マチュピチュはクスコかアグアスからの日帰りで十分だと思います。　2日間も雰囲気に使っていたいのなら、2日分の入場料が必要でしょう、どんな事情かは解からないので何ともいえませんが～。