日没後は出歩かない

女性のみの場合、一人であっても複数人であっても、日没後に出歩くのは危険です。
治安のいいところであっても、日本とは違います。ましてや夜はなおさら。
どうしてもというならタクシーを使うべきです。
プラハ市内も観光の時間が足りなさそうならタクシーを使うと、ぐっと時間が節約できます。
どうせ海外に行くのだから、多少のお金がかかってもいろいろ見たほうがいいですよ～

プラハ城の混雑具合はわかりませんが、やはりお昼ごろが一番混むようです。
といってもどのくらいかはわかりませんが…。
私だったらプラハ城を朝一に行って、ペトシーンの丘は余裕があったら行くくらいの予定で組みます。

というか、ショッピングがお好きなようですが、全部の店に１～２時間かける、とかでない限り両日とも全部まわれると思います。
体力面で不安があるなら、シャワーを浴びるときに手足の先（肘下、ふくらはぎあたり）に温水と冷水を交互にかけると、血行が良くなって疲れが取れやすいですよ。
温水→冷水→温水→冷水の順で、各1分ほどの間隔で何回か繰り返します。
手足だけにして、胴体部分は避けた方がいいでしょう。
最後は冷水をさっとかけて終わるとより効果的です。