まあ大丈夫でしょう

少なくともGVBのトラム&バスルールには大型荷物がルール違反である記述はないです。

https://en.gvb.nl/klantenservice/reisregels/reisregels-tram-en-bus

車体にもよりますが、荷物が置けそうなところは一番後ろのスペース、連接部、車椅子スペースでしょうか。
上記によるとそのいずれかはベビーカー置き場だそうで、さらに車椅子が最優先となっております。

また、平日7:00-9:00、16:00-18:30のラッシュ時は自転車持ち込み不可ともありますので、この時間帯の大型荷物持込は避ける方がいいかもしれません。

8月の観光（バカンス）シーズンに行きましたが、荷物が置けないほどめちゃくちゃ混んだ記憶はないです。

また、何処から何処へ乗車するかにもよりけりで、当然アムステルダム中央駅付近は混みます。
ホテルの位置にもよりますが、スキポール空港から中央駅経由でホテル等に移動をお考えなら、空港から南駅に行ってトラムに乗車する方が空いているでしょう。

アムステルダムのトラム面白いですね。
日本では壊滅したガントレットがあったりして飽きませんね。