私ならば

１２日間と短期間なので取捨選択が重要かと思います。

ベオグラード　→　サラエボ　→　モスタル　→　ドブロブニク
　→　コトル　→　ブドバ　→　シュコドラ　→　プリズレン　→
　プリスチーナ　→　スコピエ　→　オフリド　→　ソフィア

こんな感じかと思います。
コソボに興味がない場合、ティラナまで行ってオフリドに行くという
のもあります。
その場合日程に余裕ができるので、代わりにのんびりしてもいいし、
他の街を入れるのもいいと思います。

１２日ということなので、スロベニア・クロアチアをカットしましたが、
こちらは別の機会にしてはいかがですか。
スロベニアもクロアチアも良いところがいっぱいあるので、
他と併せて１２日はもったいないかと。
特にスロベニアのシュコシャンケーブはお勧めです。
ポストイナは２０年前でも観光地化されていて、時間があれば
どうですかという印象です。

　人それぞれの好みと感じ方があると思います。私はどちらか
というとアドリア海沿いを旅するのが好きで特にドブロブニク、
コトル、スヴェティ・ステファン島なんかが好きです。
　ここにはいれませんでしたが、滞在するならばアルバニアの
サランダは特に好きです。

夏のドブロブニク、コトル、ブドバは混雑するので早めに予約を
入れたほうがいいですよ。

ルーマニアは個人的には好きになれないので、カットしてもいいかも。
（２回しか行っていないですけどね。）

良い旅を。