私のそのように考えていました

トピ主さんはこの辺りのことを詳しく書いてないので
断定できませんが私もオーバーブッキングではと考えて
いました。

搭乗されて空席状況はどうだったのでしょうか。
ご夫婦が離れた席になったということは満席とも想像した
のですがいかがでしょう。
通常は何とかやりくりして隣合わせになるよう努力して
くれるものです。

それでも何とか最後の客として席を確保できたので航空会社は
まずほっとしたかも、運が悪ければ他社便の振替えを依頼
されたかも知れません。

格安航空券の隠れたデメリットかも。

余談ですが私は積極的に席を譲りますのでCクラスの席を
提供してもらうこともしばしばです。