プエルトアロヨからボートが出ているようですが

案内は見ましたよ。
旅行会社でチケット買えると思いますが。
僕は去年、2週間でサンタクルス島・イザベラ島・サンクリストバル島周りました。
1週間で4島は慌ただしいかも。船は激しく揺れるので、連日乗るのはきついかも。
フライトを同じ島の往復ではなく、違う島でＩＮ，ＯＵＴ(サンタクルス島、サンクリストバル島)した方が効率的です。