一筆書きコース

ベネチアへはローマから日帰りする人もいるくらいですから、フィレンツェからは楽勝ですが、世界で一番素敵な都市としてベネチアを挙げる方も多いですから、最低でも1泊はされたほうがいいですよ。運河の夜景も素晴らしいので。
全部で何日あるか分かりませんが、7泊あれば、例えばローマ3泊、他2都市2泊がいいかと。
荷物が少なければ、ローマからピサへは地中海沿いに走る直行の特急列車が2時間おきにあり、フィレンツエで乗り換えよりも早く着きます。
ピサからフィレンツェ（泊）→ベネチア（泊）という一筆書きコースが効率的です。