列車で行ける所2か所+バスで50㎞以内2か所

＞バスの移動が苦手意識があり、近距離（30～50km）位しか
利用したことがありません。

あとでこのコメントを見たので、レス８を一部修正します。
コトールは60㎞以上、スプリトは150ｋｍ以上あるので取り消します。
船でコルチュラ島などへ行かれるのがいいかも。

ザグレブからプリ湖も100㎞以上あるかと。
列車なら問題ないでしょうから、リュブリャーナ（2時間12分）ポストイナ（+1時間）は絶好の日帰り観光スポットに。
ポストイナ鍾乳洞はトロッコで観光するほど欧州最大（世界2位）の規模の鍾乳洞です。美しさは世界一といわれます。
ドブロブニクと並んで今回の旅のハイライトでしょう。問題は列車の本数が少ないことで7時前の列車でないと日帰りが無理になるかと。
でもそれでいけば、リュブリャーナ城観光してからポストイナも日帰りできます。

また、リュブリャーナからブレッド湖最寄りの駅（Lesce　Bled）約1時間ごとの列車で1時間です。駅前からブレッド湖までは多発のバス（リュブリャーナ駅始発）で15分です。ブレッド湖から、さらに美しいボーヒン湖へはバス40分です。両方行っても片道50㎞以内です。

1日では両方は無理なのでザグレブに4連泊して
1日目はリュブリャーナとポストイナ日帰り
2日目はのんびりザグレブ散策
3日目はブレッド湖+ボーヒン湖

つい最近まではクロアチアもスロベニアもユーゴスラビアという一つの国でしたから、外国へ行くという意識は持たないほうがいいかと。バスが苦手な方にとっては列車だけで行ける絶景ですから。
一つの国だったころはユーゴはプリ湖、オフリド湖（マケドニア）、ブレッド湖、ボーヒン湖を有するヨーロッパで湖が最も美しい国でした。断トツに。
そのうち2か所が見れるわけです。