入国できそうですね

初めの問いを誤解したようです。
「旅行会社からダメだと言われてしまいました」というのは、パスポートの残存期間が少ないので代理店の航空券の発行に待ったがかかったのかと。それでは旅行できません。

航空券が発行されて利用予定の航空会社が搭乗できるというのなら心配ないでしょう。
ネガティブな回答でめがらさんに心配させてしまいました。

お気をつけて無事に帰国されるようお祈り申し上げます。