ペルーではダイビングは・・

まず他の方も書いてますが、何をしたいかによって行き先って違ってくると思いますよ
18日間の休みとおっしゃいますが、メキシコだって、遺跡+カリブのリゾートを堪能すれば、18日間だって短いくらいですよ
日本からカナダ経由のフライトを使って行くのがお勧めなんですが、その場合は行きか帰りにカナダによる事もできますし
ペルーの場合だと同じくカナダ経由でリマに行き、国内線を使ってクスコに行き、その翌日にでもバス+列車でマチュピチュの方に行かれるとよいと思います
これは最初にクスコを観光しようとすると標高が高いので高山病になりやすいので、それよりは標高が低いマチュピチュで高度順応する方が良いからです
マチュピチュに行ったあとは、再びクスコに戻り、その後列車でプーノに行きチチカカ湖観光
その後は国内線でリマ経由イキトスに行かれてアマゾン観光して空路リマに戻ってから帰国というのはどうでしょうか?
ペルーだとマチュピチュなどの遺跡やイキトスでのアマゾン観光などがありますが、ダイビングに適した場所は聞いた事がありません
メキシコでしたら、カリブのカンクンやコスメルでのダイビングなどもお勧めですが・・
なにしろ女性で1人となるといろいろと心配事もあるでしょうし・・
ところでスペイン語はある程度は話せるのでしょうか?
ある程度のホテルの泊まって、ヒコーキや現地ツァーで観光するならともかくとして、英語は通じないと思った方がいいですよ